焦哈爾·察爾納耶夫為車臣裔,于當年4月19日被捕。最初他沒有被宣讀“米蘭達警告”即被審訊,司法部援引“公共安全例外”規(guī)則,并打算讓專門的反恐小組審問他。4月22日,檢方以“使用和密謀使用大規(guī)模殺傷性武器導(dǎo)致死亡”和“惡意破壞財產(chǎn)導(dǎo)致死亡”起訴他?!拔覀円俅胃嬖V所有人,以無辜美國人為目標并對我們的城市進行恐怖襲擊的人,逃脫不了正義的制裁?!甭?lián)邦總檢察官稱。
經(jīng)初步審訊,焦哈爾承認制造爆炸案的動機是極端宗教信仰以及美國在阿富汗和伊拉克的戰(zhàn)爭。7月10日,焦哈爾在波士頓聯(lián)邦法院接受傳訊,涉及30項指控。審判于2015年1月開始,檢察官表示,焦哈爾是不肯悔改、赤裸裸的恐怖分子,而他的律師則強調(diào)被告的墮落與其糟糕的成長環(huán)境有直接關(guān)聯(lián),而且其哥哥塔梅爾蘭是主謀,但法庭并沒有采納律師的辯護觀點。
雖然馬薩諸塞州在1984年已經(jīng)取消死刑,但焦哈爾是在聯(lián)邦法院受審,美國聯(lián)邦政府于1988年恢復(fù)了死刑。2015年6月24日,焦哈爾正式被判處死刑。
2020年7月31日,在焦哈爾·察爾納耶夫提起上訴后,上訴法院的三名法官一致認定陪審員的人選“沒有做到公正”,并以此推翻了死刑判決。
2021年,美國司法部向聯(lián)邦最高法院提出請求恢復(fù)死刑判決。2022年3月4日,聯(lián)邦法院宣布焦哈爾·察爾納耶夫的死刑判決。目前,焦哈爾·察爾納耶夫仍在漫長的上訴階段。
2025年1月就會卸任的美國總統(tǒng)拜登,宣布將37名死囚減刑為終身監(jiān)禁,總統(tǒng)減刑令并不包括2013年波士頓馬拉松爆炸案的兇手之一焦哈爾·察爾納耶夫。